Вирус СПИДа рассмотрели в упор

Взглянув на вирус СПИДа с разрешением в несколько ангстрем, учёные обнаружили в его оболочке слабые места, которые можно использовать для атаки на «чуму нашего времени».

Оставайтесь в курсе последних событий! Подписывайтесь на наш канал в Telegram.

Исследователям из Медицинской школы Питсбургского университета (США) удалось подробно рассмотреть капсид вируса СПИДа — белковую оболочку, заключающую в себе генетический материал вируса. Разумеется, как выглядит ВИЧ, было известно и до этого, но лишь в общих чертах. На этот раз учёные задались целью как можно точнее выяснить расположение 1 300 белков, из которых сложена вирусная оболочка.

С помощью криоэлектронной микроскопии, рентгеноструктурного анализа и сверхбыстрых компьютеров учёные построили трёхмерную карту ВИЧ с разрешением в 8 Å.

Вирусный капсид решает двоякую задачу: с одной стороны, он защищает генетический материал вируса, с другой — когда вирус попадает в клетку, капсид должен выпустить генетический материал на волю, чтобы вирус начал воспроизводиться. То есть в жизни вируса есть момент, когда в его оболочке, грубо говоря, открывается отверстие, и через это отверстие вирус вполне можно было бы атаковать каким-нибудь лекарством.

Подробный объёмный портрет капсида как раз мог бы ответить на вопрос, где и когда можно осуществить такое нападение.

В статье, опубликованной, естественно, в журнале Nature, Пэйцзюнь Чжан и его коллеги описывают капсид ВИЧ как сложную решётку, состоящую из множества белковых ячеек-шестиугольников. Таких ячеек в вирусной оболочке двести. Кроме того, есть совсем немного, всего двенадцать, пятиугольных ячеек. Капсид ВИЧ сложен как бы из нескольких плоскостей, и пятиугольные ячейки появляются там, где есть углы, где одна плоскость переходит в другую. (По словам исследователей, структура капсида ВИЧ напоминает «фуллереновый конус»: там, где поверхности нужно особенно сильно искривляться, стоят пентагональные белковые ячейки.)

Именно здесь, по мнению авторов работы, находится слабое место вируса. С помощью мутантных форм вируса удалось даже обнаружить особо важные связи между белковыми молекулами. Эти связи имеют гидрофобную природу, и если их нет, капсид теряет стабильность, а вирус не может проникнуть в клетку.

Скорее всего, эти слабые места нужны и самому вирусу, чтобы, как было сказано выше, в нужный момент выпустить генетический материал в клетку. Однако их же можно использовать для борьбы с ВИЧ — нужно только иметь на руках ферменты или ещё какие-нибудь вещества, которые расшатывали бы капсид в этих точках.

До сих пор архитектурные особенности вируса при разработке лекарств против него почти не использовались. Так что, возможно, эти результаты подтолкнут исследователей к созданию нового поколения антиВИЧ-препаратов. Известно, что вирус СПИДа изменяется с огромной скоростью, благодаря чему уходит из-под удара иммунной системы. Однако он не может позволить, чтобы изменения коснулись и белков, лежащих в критических точках капсида. А это даёт право предполагать, что от лекарства, которое ударит по этим белкам, вирусу не уйти.

 

Подготовлено по материалам Питсбургского университета.
Кирилл Стасевич
compulenta.computerra.ru

Подпишитесь на ежедневный дайджест от «Континента»

Эта рассылка с самыми интересными материалами с нашего сайта. Она приходит к вам на e-mail каждый день по утрам.